공각기동대의 스핀오프 격으로
작품의 시대는 종전후인 2027년, 주인공은 쿠사나기 모토코,
공안9과의 탄생 배경과 쿠사나기가 전신의체화 된 후부터 '소령'이라고 불리기 전까지의 이야기를 다루고 있다.

Boder1 줄거리
제4차 비핵대전이 종전된 이후의 2027년.
뇌물수수 혐의를 받고 있는 육군의 마무로 중령이 길거리에서 강도에게 살해당하는 사건이 발생한다.
아라마키 다이스케는 군인 묘지에서 마무로 중령의 시체를 파내어 그 전뇌에 접속하려 했는데,
마무로 중령의 부하이기도 한 쿠사나기 모토코가 나타난다.
그런데 관 속에 있던 것은 마무로 중령의 시체가 아니라 자주 지뢰였다.
쿠사나기는 중령의 죽음에 감춰진 진실을 파헤치려고 하지만 알 수 없는 통증과 헛것이 보이기 시작하고, 오히려 중령의 살해 용의자로 몰리게 된다.

일반적인 의료보험으로는 전신의체를 감당하기 힘들었기 때문에 쿠사나기의 의체는 정부의 관리를 받을 수밖에 없었고
그 때문에 육군에서 자유롭지 못했던 쿠사나기, 마무로 중령의 추천장을 통해 자립하려고 했던 쿠사나기로서는 절실한 문제였고,
결국 수사를 도와달라는 아라마키의 의뢰를 받아들인다.